El suceso tuvo lugar sobre las 14.00 horas cuando, por causas desconocidas, un vagón del tren que cada lunes se dirige a Azuqueca de Henares (Madrid) se salió de la vía a la altura de la rotonda próxima al Acceso Sur del recinto portuario.
Poco después, personal de ADIF y de la empresa propietaria del convoy, Continental Rail, comenzaron a trabajar para restablecer la normalidad en el convoy de 450 metros y que sufrió el problema en su tramo central.
Afortunadamente, uno de los carriles del Acceso Sur permitió descargar la circulación, controlada en ese punto por la Policía Portuaria. Sobre las 17.00 horas el incidente pudo ser resuelto y el tren reemprendió su marcha con normalidad.